原料药和杂质结构确认一般应用在药物申报中，结构确证是药物申报过程中必不可少的资料之一。天然组分药物成分经过提取，对已提取成分进行结构分析是中药研究的重要环节。
药品检测的目的在于防止不合格药品流入市场，保证药品的安全性。检测药品是否含有有毒有害物质；检测是否含有相应的药效成分，是否达到标准；真假药品鉴别。
分析药物配方，实现模仿生产或协助药品研发。
分析药物配方，实现模仿生产或协助药品研发。
药物中的残溶剂系指在原判药或辅料的生产中、以及在制剂制备过程中使用或产生而又未能完全去除的有机溶剂。根据有机溶剂对人体及环境可能造成危害的程度，ICH将有机溶剂分为避免使用、限制使用、低毒和毒性依据尚不足四种情况。因残留溶剂会影响产品的安全性，故需对其进行研究。通常我们在确定了需要进行残留量研究的溶剂后，需要通过方法学研究建立合理可行的检测方法。目前，残留溶剂的测定一般采用气相色潜法，且推荐使用毛细管色谱柱-顶空进样系统。
基因毒性杂质是指能直接或间接损害DNA，引起DNA突变、染色体断裂、DNA重组及DNA复制过程中共价键结合或插入，导致基因突变或癌症的物质。潜在基因毒性杂质结构中含有与基因毒性杂质反应活性相似的基团（如肼类、环氧化合物、N-亚硝胺类等），通常也作为基因毒性杂质来评估。新药合成、原料纯化、储存运输（与包装物接触）等过程中都可能产生基因毒性杂质。
